Летная история столичного аэропорта «Манас» начинается с 4 мая 1975 года, когда был открыт первый регулярный рейс № 613-614 по маршруту Москва «Домодедово»-Фрунзе «Манас». Именно эту дату принято считать днем рождения главной воздушной гавани республики. Имя «новорожденному» аэропорту дал известный писатель Чингиз Айтматов в честь великого героя кыргызского эпоса «Манас» в 1980 году.
В 1992 году указом президента Кыргызской Республики авиационная гавань вошла в состав образованной Национальной авиакомпании «Кыргызстан аба жолдору».
В 1993 году произошло знаменательное событие – Кыргызстан стал полноправным членом Международной организации гражданской авиации (ICAO – International Civil Aviation Organization).
В 1994 году открывается первый международный рейс Бишкек-Стамбул.
В 2001 году в соответствии с Концепцией разгосударствления и приватизации АО Национальная авиакомпания «Кыргызстан аба жолдору» была завершена его реорганизация с выделением трех самостоятельных структур:
- АО «Национальный авиаперевозчик «Кыргызстан аба жолдору»
- АО «Международный аэропорт «Манас»
- ГП «Кыргызаэронавигация»